El Consejo Directivo es el máximo organismo orientador para la dirección general del Colegio en el marco de su Proyecto Educativo Institucional.
Está conformado por:
- Rector
- Director Académico
- Director de Bienestar Estudiantil
- Director de Pastoral
- Director Administrativo y Financiero
- Asistente de Rectoría
- Tres profesores (no padres ni acudientes, representantes de los ciclos académicos)
- Dos representantes de los padres de familia
- Jesuita en representación de la Compañía de Jesús
- Representante del personal administrativo
- Presidente del Consejo de Estudiantes
- Presidente de la Asociación de Antiguos Alumnos (A.S.I.A. San José).
